
Tokyo connaît actuellement des averses de pluie qui semblent perturber le rythme habituel de tous ceux qui y vivent sans fin. Au milieu de cette déprime apparemment éternelle arrive l'étudiante fugueuse du lycée Hodaka Morishima, qui lutte pour se soutenir financièrement, finissant avec un emploi chez un petit éditeur. Dans le même temps, l'orpheline Hina Amano s'efforce également de trouver du travail pour subvenir à ses besoins et à ceux de son jeune frère. Les deux destins s'entremêlent quand Hodaka tente de sauver Hina des hommes louches, décidant de s'enfuir ensemble. Par la suite, Hodaka découvre que Hina a un pouvoir étrange et stupéfiant : la capacité d'appeler le soleil chaque fois qu'elle prie pour lui. Avec le temps inhabituel de Tokyo en tête, Hodaka voit le potentiel de cette capacité. Il suggère que Hina devienne une « fille du soleil », quelqu'un qui videra le ciel pour les gens quand ils en auront le plus besoin. Les choses commencent à les chercher au début. Cependant, il est bien connu que le pouvoir vient toujours avec un prix élevé...