
Il y a des années, un incident tragique a frappé une jeune princesse quand ses deux parents sont morts. Dévasté, il semblait que rien ne calmerait cette pauvre âme. Cependant, un prince voyageant dans la région est venu voir la princesse, espérant la réconforter. Après avoir essuyé ses larmes tristes, le prince lui donna un anneau portant un emblème de rose et lui dit aussi longtemps qu'elle tient sur l'anneau, ils sont destinés à se rencontrer à nouveau. L'événement laisse une profonde impression sur la fille, Utena Tenjou, la conduisant à devenir un prince elle-même. Des années plus tard, Utena fréquente l'Académie Ootori, reconnue par le même emblème rose que celui de sa bague précieuse. Là, attirée par l'odeur des roses, elle est témoin d'Anthy Himemiya qui s'occupe des fleurs, accompagné du président du Conseil des étudiants Touga Kiryuu et du vice-président Kyouichi Saionji, qui semblent se disputer sur Anthy. Alors qu'Utena ne pense rien à l'événement, le conseil des étudiants se réunit pour discuter d'une question importante. Par la suite, un malentendu amène Utena à être traînée dans le monde des Duellistes, ceux qui ont des anneaux semblables à la sienne. Les Duellistes se battent pour la propriété de la Rose Mariée, Anthy Himemiya, qui aurait une grande puissance. Voulant prouver ses capacités en tant que prince, et irrité qu'Anthy soit lésée et objectifiée, Utena décide de lutter contre les Duellistes pour la sauver du sort cruel.