

En 2027, un an après la fin de la quatrième guerre mondiale non nucléaire, une bombe a explosé à Newport City, tuant un grand marchand d'armes qui pourrait avoir des liens avec la mystérieuse Organisation 501. Le responsable de la sécurité publique Daisuke Aramaki engage l'utilisateur de cyberprothèses et le hacker extraordinaire, Motoko Kusanagi, pour enquêter.