

Poussé au bord de l'extinction par « Aragami », une race de monstres dévorants, l'humanité fait sa dernière place dans des points isolés de résistance. Invulnérables aux dommages conventionnels, seules les armes « cellules d'Oracle » — composées de la même matière qui constitue Aragami — peuvent tuer ces créatures. Cependant, en raison de leur capacité à s'adapter à Dieu, les Aragami développent bientôt une immunité supplémentaire. N'ayant pas d'autre espoir d'escroquer l'ennemi, les restes des gouvernements humains décident de faire exploser un réacteur nucléaire et d'éliminer les monstres face à l'Eurasie. Les soldats chargés de cette mission sont aidés par trois « God Eaters » envoyés de la Branche Fenrir-Extrême-Orient, une organisation contrôlant ce qui reste du Japon. Les armes ultramodernes qu'ils manient, appelées Arcs de Dieu, sont supposées capables de percer à travers la peau d'Aragami et de déchirer leurs cœurs, pulvérisant les monstres. Ces puissants guerriers peuvent être le dernier espoir de l'humanité de s'affranchir de la menace d'Aragami et d'éviter l'extinction totale.