
Avec des rapports de monstres terrorisant le réacteur du mont Nibel, la Shinra Electric Power Company dépêche leur force de combat d'élite SOLDIER pour enquêter. Accompagné de son collègue SOLDIER First Class Zack Fair et d'un petit contingent de gardes de compagnie, le héros de guerre Sephiroth doit évaluer l'état du réacteur Mako à la demande de l'entreprise. A Nibelheim, le village qu'alimente le réacteur, Sephiroth découvre la source des monstres et les origines du légendaire projet Jenova de Shinra. Courir dans les bois des mois plus tard, Zack n'est plus le héros qu'il rêvait autrefois de devenir. Il fuit le département des affaires générales de la Shinra Electric Power Company, plus connu sous le nom de Turcs, qui cherchent désespérément à enterrer les preuves vivant au sein des deux.