
Il y a deux ans, le monde a changé pour toujours. Le jeune Cloud Strife et son groupe d'amis ont peut-être vaincu Sephiroth et déjoué son plan d'écraser un météore géant dans la Terre, mais cette victoire n'a pas été sans coût. La ville très peuplée de Midgar fut presque déchirée dans le conflit. Heureusement, beaucoup de citoyens de la ville ont pu évacuer vers la sécurité, et dans les années qui ont suivi ont formé une nouvelle maison appelée Edge. Final Fantasy VII : Les enfants de l'Avent tournent autour de Cloud et Tifa alors qu'ils essaient de faire de nouvelles vies pour eux-mêmes, ainsi que pour ceux qui les entourent, dans cette nouvelle ville. Ensemble, ils gèrent un service de messagerie, et ont tendance à leur ami commun Barret. Denzel, Cloud et de nombreux enfants souffrent d'une mystérieuse nouvelle maladie appelée "Geostigma". Les enfants de la ville ont une autre menace sur leur tête – un trio d'hommes puissants kidnappent des enfants infectés pour des raisons inconnues. Nuage est déterminé à sauver ces jeunes, non seulement de Geostigma, mais aussi des kidnappeurs. Il n'a cependant aucune idée que ces hommes partagent un lien avec son ancien ennemi, Sephiroth, et la quête de Cloud pour les vaincre le ramènera en conflit avec les démons de son passé. S'il y a de l'espoir de vaincre ces menaces, cela s'inscrit dans les liens d'amitié entre Cloud et ses alliés qui ont sauvé le monde une fois, et qui doivent maintenant le faire à nouveau.