

Le Festival Daihasei a commencé, et cela signifie bien sûr que le collège de Tokawadai, une prestigieuse école secondaire pour toutes les filles, est aussi en compétition. Malgré la participation de l'As de Tokiwadai, Mikoto Misaka, les autres étudiants qui y participent mettent encore leur maximum d'efforts à gagner, même si l'exploit peut sembler impossible contre sa puissance écrasante. Cependant, tout n'est pas amusant et jeux. Grâce au festival, Academy City s'ouvre au monde extérieur, et diverses factions ont commencé à trouver des moyens d'infiltrer la ville. Misaka semble être sur leur radar, et au fur et à mesure que le festival avance, les gens qui se cachent de l'ombre commencent à émerger... Toaru Kagaku sans Railgun T ramène l'Ace Tokiwadai et ses amis alors qu'ils plongent plus profondément dans le côté sombre de Academy City. Des attaques terroristes aux projets clandestins impitoyables, tout est possible dans cette ville.