
Quand il était enfant et qu'il a attrapé des insectes, Jin Mikuriya a rencontré fatalement une divinité, qui est devenue l'inspiration de sa nouvelle œuvre d'art: L'Esprit d'arbre. Essayant de trouver un moyen d'amener la statue de bois à l'école, Jin croit que le reste de la journée sera passé à admirer son travail. Mais avant même de pouvoir le soulever, la sculpture commence à absorber la terre autour d'elle et explose en une jolie fille ! La jeune fille, Nagi, qui se présente comme gardienne de la terre, proclame que Jin doit l'aider à se débarrasser des « impuretés » qui ravagent la terre. Mais hélas, en raison de la coupe de l'arbre de Nagi et de l'épuisement de ses pouvoirs, elle se retrouve à nettoyer les impuretés avec seulement une baguette magique ! Avec leurs vies maintenant entremêlées, Jin et Nagi trouvent des moyens d'en apprendre davantage les uns sur les autres à travers les quantités infinies d'antiques quotidiens.