

L'humanité se trouve dans une lutte lorsque le niveau de la mer commence à monter à un niveau sans précédent en 2039. Pour aggraver les choses, de puissants ennemis ressemblant à de vieux navires de guerre appelés la flotte de Fog errent les eaux, coupant la communication et le transit vers diverses régions. Toute tentative de représailles se termine par un échec avec les armes actuelles de l'humanité. Seul Gunzou Chihaya a une chance contre la Flotte de Fog en tant que capitaine du sous-marin I-401 Fog. En conséquence, Gunzou et son équipage, connu sous le nom de Blue Steel, sont chargés d'une mission critique de livraison par le gouvernement japonais : ils doivent livrer aux États-Unis le dernier espoir de l'humanité contre la Flotte de Fog, la Tête de Torpille Vibration, à travers des eaux hostiles pour la production de masse. Bien qu'il s'agisse d'un conflit inséparable, Blue Steel ne cherche qu'une solution pacifique. Alors que Iona entreprend la mission actuelle et les tâches au-delà, l'équipage défend ses valeurs même face à des situations difficiles.