

Les Gamilians font encore face à leur plus grand obstacle : leur planète meurt à un rythme alarmant. Pour sauver son peuple et le déplacer sur des terres habitables, Aberdt Desler feint de se soumettre à la domination oppressive de la planète Galman, qui abrite une race presque identique aux Gamilians. Le véritable objectif de Desler est de prendre le contrôle et d'accélérer le salut de sa nation. Cependant, alors que les Gamilians commencent leur migration, une puissance massive non identifiée les attaque et déforme complètement leur planète jumelle, l'Iscandar, la maison de la Reine Starsha. Pendant ce temps, la Terre célèbre le succès du magnifique vaisseau Yamato et de son équipage héroïque. Une nouvelle génération de recrues prometteuses rejoint Yamato et ses deux nouveaux navires de soutien, dirigés par Yuki Mori et Shirou Sanada. Mais tout le monde n'est pas d'accord avec les décisions passées de son capitaine, Susumu Kodai. Au cours de la mission d'entraînement et de la rencontre diplomatique du Yamato avec les Gamilians, l'équipage apprend la catastrophe récente et, contre tout ordre, Kodai ordonne à la flotte d'Iscandar d'aider les réfugiés survivants.