

Touma Kamijou ne peut pas prendre une pause. Après l'invasion de la ville de l'Académie, les tensions politiques continuent d'augmenter alors que les factions scientifiques et magiques s'affrontent. Il semble que Academy City ait l'intention de déclarer la guerre contre l'Église catholique romaine, plongeant ainsi le monde entier dans la guerre mondiale. Touma se retrouve bientôt sur les lignes de front, s'efforçant de protéger ses amis et alliés. Toaru Majutsu pas d'indice III sert de dernier volet de la franchise originale que Touma, Accélérateur, et le vrai Niveau 0 Shiage Hamazura continuent leurs voyages séparés, menant jusqu'à l'acte final de la série originale de romans lumineux.