
Après avoir été envoyé pour enquêter sur la disparition alarmante de quatre ninjas porteurs de lignées de sang de différents pays, Kakashi Hatake, Naruto Uzumaki, Sakura Haruno et Sai ont réussi à découvrir où ils se trouvaient et à informer le Hokage. À l'improviste, les autres arrangements de Tsunade s'effondrent lorsque Hiruko – le cerveau derrière l'incident et aussi un ancien ninja Konohagakure obsédé par le pouvoir – semble annoncer qu'il a absorbé les capacités uniques des ninjas disparus. Sur le point de devenir invincible, il cherche une limite de sang de plus avant de commencer une guerre totale pour prendre le monde en main. Comme les liens passés de Konohagakure avec Hiruko soulèvent des soupçons parmi les nations quant à son implication dans l'affaire, Tsunade reçoit un ultimatum pour résoudre la crise. Parti sans autre choix, elle décide de suivre l'exemple de Kakashi après avoir présenté un projet audacieux et salutaire, une proposition qui pourrait l'envoyer à mort. Cependant, Naruto s'oppose à un tel plan! Malgré la décision du Hokage, il est déterminé à sauver la vie de son professeur, même si cela signifie combattre ami et ennemi.