
Un après-midi pluvieux, l'inspecteur Boys est témoin d'un meurtre en face. Barré par la circulation, le coupable s'enfuit et Conan Edogawa est laissé un seul indice par un détective mourant. Quelques jours plus tard, un autre détective est trouvé assassiné dans un parking, laissant la police rattrapé. Suspicieux que le coupable soit l'un des leurs, tout le monde dans le service de police sans alibi est suspect. Mais en dépit d'être en état d'alerte, ils sont dépassés et subissent une nouvelle attaque – cette fois avec Ran Mouri se trouvant dans le feu croisé. Traumatisée, Ran se réveille à l'hôpital avec une amnésie rétrograde, ne se souvenant de rien de sa vie. Bientôt relâchée, elle peine à se souvenir de son passé et devient peuruse de ne pas retrouver ses souvenirs avant d'être prise pour cible par le tueur pour ce qu'elle a vu. Comme elle est gardée par ses amis et sa famille, il revient à Conan de rassembler les indices et de trouver qui est le meurtrier avant qu'ils ne frappent à nouveau.