
Zenigata arrive sur le bateau "Machine Gun Kelly", un casino sur l'eau appartenant à la mafia, parce que Lupin prévoit de voler l'argent du casino. Lupin et son gang parviennent à pénétrer par effraction dans la chambre forte du navire, mais n'ont pas pu s'échapper avec l'argent en raison de la fusillade de Zenigata. Cependant, il y avait un autre but que le navire avait, un dont Lupin était au courant, de chercher un navire coulé rempli d'or. Lupin a réussi à voler ces données pendant qu'il était sur le navire, cependant, maintenant ils doivent lutter avec Zenigata, la mafia, et une organisation secrète dont la base est sous Alcatraz, alors qu'ils tentent de découvrir le secret derrière l'organisation et le trésor coulé.