

Grâce aux sacrifices de héros de guerre comme Amuro Ray, la 105e année du siècle universel voit une ère de paix dure mais courte. La Fédération de la Terre maintient une position militariste sur la planète et ses colonies spatiales environnantes. Bien que la rébellion de Char Aznable contre la Fédération négligente ait rencontré son échec ultime, sa philosophie révolutionnaire de la vraie liberté pour tous les êtres humains vit. Bien que fils d'un célèbre commandant de la Fédération, Hathaway Noa incarne à la fois la loyauté indéfectible du soldat Amuro Ray et la passion militante du chef rebelle Char Aznable. Hathaway, hanté par les souvenirs de la rébellion de Char, dirige une faction dissidente de son propre nom, Mafty. Il adopte le pseudonyme "Mafty Navue Erin" et commet des actes de violence en révolte contre la tyrannie croissante de la Fédération. Après avoir déjoué la prise de contrôle hostile d'un avion par un groupe terroriste prétendant frauduleusement être Mafty, l'identité secrète d'Hathaway est découverte par une jeune femme nommée Gigi Andalousie. Hathaway se lie d'amitié à la fois avec Gigi et le colonel de la Fédération Kenneth Sleg, mais sa double vie les met en danger alors que le conflit armé entre Mafty et la Fédération prend la tête.