
L'histoire de Fortune Arterial tourne autour du protagoniste masculin Kohei Hasekura, qui transfère dans une prestigieuse école publique dans le style d'une école anglaise de six ans englobant des étudiants du premier et du deuxième cycle. L'école est située sur une île appelée île de Tamatsu au large du Japon, et la seule façon d'y arriver est en bateau. Peu après son transfert, il découvre que l'un des étudiants de la classe à côté du sien, Sendo Erika, est en fait un type de vampire.