
La cinquième guerre du Graal à Fuyuki City a atteint un tournant dans lequel la vie de tous les participants est menacée comme l'ennemi caché se révèle enfin. Comme Shirou Emiya, Rin Toosaka et Illiasviel von Einzbern découvrent la nature véritable et corruptrice de l'ombre qui a envahi toute la ville, ils réalisent à quel point la situation est terrible. Pour protéger leurs bien-aimés, le groupe doit s'opposer à la force ennemie apparemment insurmontable, même si certains de ces ennemis étaient autrefois leurs alliés, ou peut-être quelque chose de plus intime. Alors que commence le dernier acte de cette guerre chaotique, les idéaux selon Shirou seront bientôt remis en cause par un dilemme épouvantable : est-il vraiment possible de sauver un monde où tout semble avoir mal tourné ?